控制器ECU為柴油機系統中最重要的零件，控制著報警系統、水溫系統、油溫系統、機油壓力系統及轉速系統等，如出現故障機組將停止運行。柴油機控制器帶手動及全自動控制功能，當自啟動信號輸入或人工按下啟動按鍵，控制器便自動完成自啟動、機組運行、故障停機保護等程序控制和過程控制。

柴油機組在自啟動及運行過程中出現異常情況時，控制器可根據預設參數判斷其故障，并通過面板的顯示屏和相應的指示燈同時顯示故障原因，外接蜂鳴器用戶可接收自動報警信號；機組也將同時停機，對機組實施保護。 所以當單體泵柴油機控制器出現故障損壞現象，需要及時進行更換。（下圖為單體泵柴油機控制器）

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